來到零第 3 集, 地圖沒再擴大到鬼鎮, 反而回到鬼屋的形式. 不過, 可以操作的人物則由 1 位變 3 位 : 黑澤怜 (今集主角 - 靈力及 HP 在三人中算中位), 雛咲深紅 (第一集的主角-今回變了配角, 靈力在三人中最強, HP 則反之最弱) 及天倉螢 (第二集主角天倉澪的叔叔 - 配角二,靈力在三人中最差, HP 則最高). 而且, 今集可以拾到的菲林及回復道具比前 2 集少. 不過,如果離開夢境, 返回現實世界再入夢的話, 本身持有的部份菲林 (14 式及07式), 萬葉丸及HP 都會回復到故有的設定數量. 而且, 返回惡夢中時, 可以拾到的14式菲林及萬葉丸也會重新設有. 所以, 與惡靈戰鬥後如情況太差的(快沒菲林或 HP 過低又欠回復藥品, 找出口回到現實, 再回到惡夢中比較好.
麻生優雨與雛咲真冬(深紅的哥哥) 及天倉螢是一起研究民俗學的朋友. 在真冬失蹤後, 優雨就開始照顧真冬的妹妹深紅. 而深紅稍後成了他女朋友-自由攝影師黑澤怜的助手. 他與天倉螢則繼續研究近來不同的都市傳說, 沉睡之家之其中之一. 天倉螢的姪女-天倉澪在水壩失蹤一星期後被發現及送往醫院治療. 澪的姐姐還在失蹤, 澪可能因受刺激過度, 說不出發生什麼事. 最近更開始常長時間沉睡中, 情況與沉睡之家的患者相似. 而根據資料, 患者最後會失蹤, 只遺下一片黑色人形痕跡. 螢希望能藉研究, 找到治療澪的方法.
2個月前, 優雨與怜一起發生車禍. 怜只是受傷, 優雨卻死了. 怜好不容易在傷痛中站起繼續工作. 在一次到傳聞的鬼怪廢屋拍攝時, 驚見於轉角處出現優雨的身影. 怜一心追上去時, 突身處不知的大宅中. 追尋著優雨的身影, 來到大宅的深處, 只見一名滿身刺青的女人向她走近. 在接觸的一刻, 怜驚見自己動彈不得地躺在地上, 四名巫女衣裝的小女孩(鎮女)手持刺青木要打在她的四肢上. 身上更不斷被刺青侵蝕. 回過神來才發現自己還在廢屋之中. 深紅在身後關心的問她有沒有發生什麼事. 怜覺剛才只是仿如一場惡夢.
回家後沖洗所拍之照片時, 發現當時的所拍之照片真的拍下了優雨的身影. 難度那不是夢? 而在當晚, 怜在夢中又來到白天所到過的大宅. 在大宅探索時, 偶然拾到一部舊的照相機(個人認為是優雨給她的) 該照相機機竟能對付在大宅內遇到的惡靈. 而在前往大門的通道上, 怜遇上一名女士. 那名女士在怜叫她時, 驚恐的看著怜的身後. 怜轉身一看, 只見之前那名刺青女向她們走來. 那名女士恐慌地逃走, 怜則向大宅的大門逃去. 在刺青女撞到怜的同時, 怜亦逃出宅外. 怜由夢中驚醒, 在陪同著痛楚的同時, 背部被刺青女撞到的地方, 開始出現和刺青女身上相似的刺青圖案 ......... 雖然是一瞬即逝.
之後, 怜每晚也會在夢中到訪那間大宅. 為了查探為何優雨會在大宅內出現及那間大宅的秘密, 怜漸漸深入大宅內. 亦會在夢醒時請深紅調查她在夢中拍到的照片. 一天醒來後, 怜發現深紅竟然唱出在夢中聽到的歌謠. 當晚, 更透過深紅來到大宅中. 深紅在大宅中是追尋她哥哥真冬的身影. 而且, 不止深紅, 之後她還透過一名男人的夢來到大宅中. 其後她知道這名男人是寄信給優雨的朋友-天倉螢. 天倉螢則是在夢中追尋著澪的身影. (其怪的是澪不是亡者)
經過多日的追查, 知道那間大宅被稱為眠之家. 古時, 於某處有一個名為久世宮的地方. 久世宮內的神社是禁止男性進入. 不過, 為了延續, 宮主會招待外人進來. 而久世宮是以將人失去親友而痛苦之思念經由特別的墨刺於巫女身上, 讓巫女替人承受思念之痛苦(稱為納柊). 之後, 該名全身刺青的巫女便會送往神社深處, 經由四名鎮女 (7-9歲的小女孩) 用刺青木釘於終之淵的宮內, 讓巫女永遠沈睡. 一天, 一名民俗學者 - 柏林秋人 (外貌與天倉螢一樣) 也被招待進來. 與久世宮內一名叫鏡華的女子相戀. 秋人送給鏡華一些特別的耳飾後被送走 (下場未明). 鏡華其後生了一名男孩, 取名為要. 因男孩不能留在久世宮. 故此鏡華將一個耳飾連同男孩一起送往附加的村子被人收養. (免得被殺)而其後, 她又生了一名女孩- 雨音. 女孩其後成為鎖女之一. 雨音有被告知自己有一個哥哥, 他會持有和母親一樣的耳飾. 要長大後與村內的一名女孩零華相戀. 要把耳飾送了給零華, 自己其後往尋找親生父母. 而零華在一場意外,失去親人後被招入久世宮更為下一任刺青巫女. 要在睡夢中夢到久世宮及好像零華的女子被刺上刺青, 便回到村子. 知道零華入了久世宮後, 便混進要入久世宮的人群中, 想要找機會再見零華. 雨音看到零華手持的耳飾, 知道零華的戀人會是哥哥而幫助了要進入神社內. 在刺青儀式之後, 零華被釘於神社 要亦悄悄的追尋到來. 看到戀人的身影, 零華剛展露笑容的下一刻, 卻見要被身後尾隨的久世家當主殺死. (因要打破了禁忌) 愛人被殺的悲痛下, 使零華身上的刺青深入雙目中, 讓所有苦楚反射開來. 讓久世宮轉眼化為狹間.
久世家的當主為了阻止狹間的擴大及鎮壓化為怨靈的零華, 招來大量工匠修建眠之家. 亦把那些工匠製成人柱. 而且, 處置完幫助要的雨音後, 亦將自己及其餘 3 名的鎮女製成封印的人柱. 可是, 封印還是不完全, 一些失去親友的人還是會被拉進眠之家中, 在這裡追尋親友的身影, 直到最後於現實消失不見, 化作惡靈徘徊眠之家中.
多日來查探的代價是怜身上的刺青已漸由背部擴散到全身; 深紅更是在一天後昏睡不醒 (這個玩家可以選擇去追真冬的幻影 or 在返回現實世界的大門前被刺青女捉到)天倉螢這時剛好來拜訪. 看到深紅的情況, 怜想要放棄了. 不過, 螢則認為還有希望, 說他會找到可以鎮壓零華的方法. 可是, 他好不容易
地找到四支刺青木, 深入終之淵的宮內想要釘於刺青巫女的四肢時, 卻發現零華的四肢早已被釘上刺青木. 在他不知所措時, 零華四肢的刺青木自動掉落. 他想逃出宮時, 宮門卻被關上.
怜在夢中驚醒來到客廳時, 只見原先躺在沙化上的天倉螢已消失不見, 餘下一個炭化的黑影. 怜在深紅房間的天花暗室找到優雨生前收集到, 應該是要給零華的耳飾. 再次入夢, 照著零華的引導找齊封印鏡的碎片合成回一面鏡子. 將鏡子放於祭壇後, 來到終之淵, 打敗零華的怨靈後. 在宮下, 用小舟將她和要的屍體送往大海的彼方(相信是黃泉的地方). 而她在前往大海彼方的鬼魂中, 見到優雨. 怜邊叫邊追上前, 可是優雨卻阻止她一起走. 說只要她還活, 記著他的話, 他就好像還活著似的. 優雨離去前還取走了怜身上的刺青.
怜在夢中醒來, 發現身上的刺青已經消失不見 - 惡夢終於完結了.
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第一次玩的話, 只有 ending 1 - 最後只有怜及深紅得救. 而要取得 ending 2, 便要在 load game 玩第二次時(難度不限, easy mode 也可以取得), 天倉螢要在 12 刻時打敗鏡華, 得到她梳妝台的鎖匙, 取得台內收藏了鏡華的耳飾. 那麼到 13 刻時, 怜便會見到他在沉睡不醒, 而非是炭化. 在 CG 後, 以照片交待結局時便會見到他醒來以及隨後帶澪來拜訪的照片.
