時間來到學年尾, 3 年級的中條, 服部, 五十里, 花音等人畢業. 而剛好北山家有份出資, 五十里家有份參與興建的, 位於沖繩久米島的人工島完工, 要舉行竣工派對. 於是, 一行畢業生打算到沖繩畢業旅行, 順便出席派對.
另一方面, 達也接到四葉的指令, 現處於鎖國狀況的澳洲特務人員要對人工島及派對進行破壞工作, 要他前往阻止. 所以, 他與深雪表面上是以四葉家代表出席在因幾年前的沖繩事件而舉行的慰靈祭, 實際是暗地裡解決該次破壞活動. 而這次不止有澳洲特務兵, 還有大亞連合軍的逃兵. 所以, 上次的橫濱騷亂的敵人陳祥山, 呂剛虎, 今回暫時會和獨立魔裝大隊的聯手. 當然, 對他們會說達也是四葉家派來的幫手, 不會透路達也本身原是大隊成員的身份.
而澳洲來的特務兵中, 其中一位是外表尤如12,13歲的女孩 (年齡卻是20多歲). 花音他們還被騙了, 協助她逃離要追捕她的軍人. 雖然, 經達也他們的努力, 在派對舉行之前捕獲及阻止了破獲主力的人員. 但澳洲的特務兵卻還是要繼續破獲工作, 而且將五十里啟也列為目標之一. 雖然軍隊有派人暗中保護他. 可是, 特務員以一面之緣順勢脅持花音要脅要啟跟她們走. 幸好在多人協助下, 最後也有驚無險. 而達也今回因有服部, 桐原等畢業生暫時加入的活躍 (雖然本人對此感非常頭痛), 變得沒大表現地完成任務.
下篇就進入三年級篇.
